南京市莫愁中等专业学校是一所经国家教育部考核评估认定的全日制国家级重点职业学校，拥有三年制中职、五年制高职和中高职3+3分段培养三个层次的办学资格。学校位于南京市建邺区，毗邻奥体中心场馆，现有教职工280余人，在校生3300余人。学校先后获得江苏省四星级中等职业学校、江苏省高水平示范性职业学校、江苏省模范学校、江苏省德育先进学校、江苏省技能大赛先进单位，2016年被评为第三批“江苏省高水平现代化职业学校”，2019年被评为江苏省现代化示范性职业学校,，2020年学校被评为江苏省中等职业学校领航计划建设单位，整体办学水平居全省同类学校前列，具有显著的办学成效和较高的社会声誉。
  学校设有药学系、电子信息系、现代服务系和文化艺术系四系部，拥有药物制剂技术、移动互联应用技术、商贸服务、文物修复与保护四大专业群。其中文物修复与保护、连锁经营与管理专业为江苏省特色专业；药物制剂技术、电子与信息技术专业为江苏省品牌专业。药品生产技术专业群、文物修复与保护专业群为省现代化专业群；非遗手工技艺实训基地、药物制剂技术实训基地为省现代化实训基地。2017年，南京市人民政府批准学校成立“南京非物质文化遗产专业学院”，2018年南京市教育局批准学校成立"制药专业学院”。